Introducción: La proliferación de un gran número de hongos, enfermedades y plagas, a causa del desequilibrio de la micostasis del suelo, se debe principalmente al uso irracional de pesticidas, fungicidas y al empleo de prácticas agronómicas ineficientes, como el monocultivo, siembras tradicionales y la deforestación. Factores que han causado serios problemas en el equilibrio ambiental y la salud humana. Una de las posibles alternativas para regular este desequilibrio, es la aplicación los extractos de origen vegetal para el control de los hongos, plagas y enfermedades en los cultivos. Objetivos: “El objetivo de esta investigación fue determinar la actividad antimicótica y la capacidad de inhibición del proceso de extracción de los aceites esenciales de Eucalipto, molle y romero, sobre los hongos (Fusarium sp. Pythium sp. Rhizoctonia sp. y Sclerotium sp), agentes causales del mal de almacigo Damping off. Aplicando la Metodología: de aislamiento, análisis de varianza, Diseño Completamente al Azar (DCA)”, separación de medias y prueba de Tukey al 5%, Determinación de dosis eficaz 50, Capacidad de inhibición, Análisis de regresión lineal; obteniendo los siguientes. Resultados: “Los hongos en estudio son de lento crecimiento, ningún patógeno pudo poblar la superficie de la caja Petri desde las 24 a las 120 horas, presentándose el ritmo de crecimiento radial en el siguiente orden: Pythium sp. con 32mm, Rhizoctonia sp. con 30.82 mm, Fusarium sp. con 23.42mm y finalmente Sclerotium sp con 19 mm. Los mejores tratamientos fueron los destilados de Eucalipto, molle y romero y la fracción del agua residual de Romero que lograron inhibir el 91,46%; 93,48% y 94.26% sobre Fusarium Sp., Phytium Sp., Rhizoctonia sp. y Sclerotium sp. respectivamente. Conclusiones: “La utilización de los aceites esenciales son eficientes para el control de plagas, por lo que haciendo una comparación con el fungicida Benomil mediante la determinación de la dosis eficaz 50% es recomendable utilizar los extractos y destilados para no causar problemas de salud, y afectaciones ambientales. Área de estudio general: Fitopatología. Área de estudio Específico: Actividad Antifúngica.