Introducción: Enterococcus sp es una bacteria que forma parte de la microbiota intestinal y también contamina el tracto genital femenino. Por lo general, no causa problemas, pero puede causar infección si ingresa al tracto urinario, al torrente sanguíneo, a heridas en la piel u otras áreas estériles. Objetivo: Determinar y cuantificar la presencia de Enterococcus sp en superficies inertes de servicios higiénicos (SH) en la Unidad Académica de Salud y Bienestar de la Universidad Católica de Cuenca. Metodología: Se realizó un estudio no experimental, cuantitativo de diseño transversal, en el que se tomó 424 muestras de 106 servicios higiénicos, las muestras fueron tomadas en las manijas de puertas y perillas de inodoro, usando la técnica del hisopado y su consecutivo aislamiento en medio de cultivo cromogénico, en los diferentes SH de la Unidad Académica de Salud y Bienestar, transportadas al Laboratorio de Microbiología de la Unidad Académica de Bioquímica y Farmacia de la Universidad Católica de Cuenca. Resultados: Se determinó mayor presencia de Enterococcus sp en los baños antes de la limpieza rutinaria que representa el 1,44% del total; mientras que luego de la limpieza 0.48%. Conclusión: El estudio indicó que los servicios higiénicos tienen mayor carga bacteriana de Enterococcus sp antes de la limpieza de los baños.